Jakob Marathon sa začína na Keskusaukiu v centre Pietarsaari, na západnom pobreží Fínska, ako súčasť letného programu Jaakon Days. Plný maratón je súčasťou dňa plného pretekov, kde sa okrem neho bežia aj Jaakon 5K, Jaakon Quarter a polmaratón, takže je niečo pre každého.
Trasa má štyri kola, ktoré zaviedli v roku 2019, keď nahradili starú trasu s výletom do Uusikaarlepyy. Bežci odchádzajú z hlavného námestia, prejdú cez Staffansnäs, pobehú po Skutnabbavägen a vrátia sa späť do centra cez Vanha Bennäsvägen. Maratón sa beží už od roku 1977 ako súčasť Jaakon Days, takže je pevne zakotvený v letnom programu Pietarsaari, nie ako samostatná akcia.