La Junior MTB Challenge (AT) tiene carreras de cross-country para ciclistas de cinco a dieciséis años, que se hacen en paralelo a la mayoría de eventos maratón de la KTM Mountainbike Challenge. Los organizadores la ven como parte clave de su trabajo de desarrollo de la cantera, diseñando circuitos pensados específicamente para niños y adolescentes, y que son diferentes a los recorridos maratón de adultos. Cada participante necesita una bici fiable y que funcione perfectamente, y el casco y los guantes son obligatorios.
La competición es de carreras XC de circuito corto, con categorías que se definen dentro del grupo junior. La clasificación general no se basa solo en el más rápido; los puntos se calculan a partir de la diferencia de tiempo de cada ciclista respecto al ganador de su categoría. Para entrar en la clasificación general, un ciclista tiene que completar al menos tres eventos, y solo se tienen en cuenta sus cuatro mejores resultados. Así, los chavales pueden competir en varias pruebas sin que una mala carrera les afecte en la clasificación general de la serie.